Klíčové postavy tajného vojenského programu po válce dostaly od okupační zprávy imunitu vůči trestnímu stíhání výměnou za poskytnutí výsledků výzkumu.
Velitel Jednotky 731 Širó Išii tak mohl pokračovat ve svém lékařském výzkumu v Japonsku až do přirozené smrti v roce 1959. Jeho zdůvodnění, proč i po zákazu testování bakteriologických zbraní Ženevským protokolem z roku 1925 v testech pokračoval, znělo: nebylo by to zakázáno, kdyby to nebylo účinné. Tokio přiznalo existenci Jednotky 731 až po desetiletích zapírání.
